一、產(chǎn)品介紹
本試劑盒采用Taqman探針熒光定量PCR法,設(shè)計(jì)專屬探針和關(guān)鍵引物,特異性好,靈敏度高,其最低定量限可以達(dá)到1fg/μL水平。DNA參考品制備過程與其它宿主細(xì)胞DNA國家標(biāo)準(zhǔn)品制備一致,因此純度高,無蛋白及離子干擾,保證了待測(cè)樣品含量檢測(cè)的準(zhǔn)確度。試劑盒提供DNA稀釋專用稀釋液,單次實(shí)驗(yàn)復(fù)孔平行性及多次實(shí)驗(yàn)間數(shù)據(jù)重現(xiàn)性好。
二、試劑盒組成
DNA擴(kuò)增 | |||
組分編號(hào) | 組分名稱 | 產(chǎn)品編號(hào)/規(guī)格 | |
VE-D050T(50T) | VE-D100T(100T) | ||
B1 | 2X qPCR Mix | 0.625mL | 1.25mL |
B2 | Primer & Probe Mix | 100μL | 200μL |
B3 | DNA Dilution Buffer | 2×1.5mL | 4×1.5mL |
B4 | DNA Control (10ng/μL) | 25μL | 50μL |
B5 | RNase-Free H2O | 0.5mL | 1mL |
B6 | 50X ROX Reference Dye(可選) | 0.15ml | 0.3ml |
* ROX參比染料為可選,是否使用取決于使用的儀器。具體可參照PART 6中的說明。
三、實(shí)驗(yàn)需要但未提供的耗材及設(shè)備
1. | 移液器:5μL-1000μL | 5. | 迷你離心機(jī) |
2. | 1.5/2ml無DNA酶/RNA酶離心管 | 6. | 無DNA酶/RNA酶8聯(lián)管 |
3. | 200μL無DNA酶/RNA酶PCR管 | 7. | 生物安全柜 |
4. | 渦旋儀 | 8. | 熒光定量qPCR儀 |
四、運(yùn)輸和保存方法
1) 所有組分均干冰運(yùn)輸。
2) 試劑盒需-20℃保存,建議一年內(nèi)使用完。其中組分B2需避光保存。
3) B2/B3/B4組分在-20℃可以保存兩年,B1/B5/B6 組分在-20℃可以保存一年。此外B1/B5/B6 三個(gè)組分也可以一起另外購買。
五、實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備
1) 使用本試劑前請(qǐng)仔細(xì)閱讀說明書,所有成分使用前應(yīng)完全化凍,低速離心,震蕩混勻。
2) 從-20℃冰箱取出,將組分B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)分別融解,輕輕顛倒(盡量避免產(chǎn)生泡沫),待溶液完全均一后再行使用。注:如B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)需一段時(shí)間內(nèi)經(jīng)常取用,可在2-8度條件下儲(chǔ)存3個(gè)月。盡量避免反復(fù)多次凍融;如解凍后沒有使用,須徹底混勻后重新冷凍。
3) B2 (Primer & Probe Mix) and B4 (DNA Control)在使用前混勻時(shí)切勿反復(fù)吹打,可采用類似清洗管壁方式。注:為減少反復(fù)凍融次數(shù)和避免污染,建議初次使用時(shí)將B4 (DNA Control)分裝儲(chǔ)存于-20℃。
4) 已融化未使用的B3 (DNA Dilution Buffer)可保存于2-8℃ 7天,若長(zhǎng)時(shí)間不用,請(qǐng)放置于-20℃。
5) 為了您的安全和健康,請(qǐng)穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作,實(shí)驗(yàn)開始前后紫外照射30min以消除環(huán)境中潛在的DNA污染源。
6) 由于熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)有極強(qiáng)的靈敏度,保持工作環(huán)境的潔凈非常重要,實(shí)驗(yàn)開始前建議完全清潔移液器及周邊工作環(huán)境,移除清理實(shí)驗(yàn)過程中用不到的任何物品。
六、操作過程
(一)DNA定量參考品的稀釋和標(biāo)準(zhǔn)曲線的制備
1) 將試劑盒中的DNA Control和DNA Dilution Buffer置于冰上完全融化,輕微振蕩混勻,低速離心10 sec。
2) 取7支潔凈的200μL PCR管,分別標(biāo)記為S0,S1,S2,S3,S4,S5,S6,每管各加入45μL DNA稀釋液。
3)在標(biāo)記為S0的PCR管中加入5μL DNA Control (10 ng/μL),即1000pg/μL,快速離心10 sec,振蕩5sec,再快速離心10 sec,該濃度可分裝置于-20℃短期保存(不超過3個(gè)月),使用時(shí)避免反復(fù)凍融。
4) S1,S2,S3,S4,S5,S6管稀釋操作同S0,稀釋方法如下:
稀釋過程 | 終濃度 | |
S0 | 5μL DNA Control (10ng/μL) + 45 μL DNA Dilution Buffer | 1000pg/μL |
S1 | 5μL S0 + 45μL DNA Dilution Buffer | 100pg/μL |
S2 | 5μL S1 + 45μL DNA Dilution Buffer | 10pg/μL |
S3 | 5μL S2 + 45μL DNA Dilution Buffer | 1pg/μL |
S4 | 5μL S3 + 45μL DNA Dilution Buffer | 100fg/μL |
S5 | 5μL S4 + 45μL DNA Dilution Buffer | 10fg/μL |
S6 | 5μL S5 + 45μL DNA Dilution Buffer | 1fg/μL |
(二)反應(yīng)體系
組分 | 體積(μL) |
2XqPCR Mix | 12.5 |
Primer&Probe Mix | 2 |
DNA template(control or sample) | 5 |
補(bǔ)加水 | 5.5 |
總體積 | 25 |
【注】:
1)根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計(jì)算本次所需Mix混合液總量:Mix混合液=(反應(yīng)孔數(shù)+4)*(12.5+2+5.5)μL(含有4孔的損失量),建議冰上操作。
2)標(biāo)準(zhǔn)品及待測(cè)樣本每個(gè)濃度做 3 個(gè)復(fù)孔。上述標(biāo)準(zhǔn)曲線的線性范圍適用大多數(shù)實(shí)驗(yàn),可根據(jù)實(shí)際需要適當(dāng)調(diào)整,如3fg/μL-300pg/μL等。
3)實(shí)驗(yàn)操作應(yīng)保持一致。加樣完成密封好管子后,請(qǐng)低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,再震蕩混勻5 sec以上,完全混勻反應(yīng)液,再低速離心10 sec,如有氣泡,需將氣泡排盡。
4)為確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果準(zhǔn)確性,建議用1X PBS將溶液中蛋白濃度稀釋至1-10mg/ml進(jìn)行加標(biāo)回收率實(shí)驗(yàn),確保回收率在50%~150%之間。
5)幾種常見儀器的匹配ROX Reference Dye濃度見下表:
儀器 | 終濃度 |
ABI PRISM 7000/7300/7700/7900HT/Step One等 | 2.5X(例如:1.25μL ROX/25μL體系) |
ABD 7500/7500Fast Stratagene Mx3000P/Mx3005P/Mx4000等 | 0.5X(例如:0.25μL ROX/25μL體系) |
Roche/Bio-Rad/Eppendorf儀器等 | 不用添加 |
(三)擴(kuò)增程序設(shè)置(2步法)
階段 | 溫度(℃) | 時(shí)間 | 內(nèi)容 | 熒光信號(hào)采集 | 循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 | 95℃ | 15 min | 預(yù)變性 | 否 | 1 |
PCR反應(yīng) | 95℃ | 3 sec | 變性* | 否 |
40
|
60℃ | 30 sec | 退火/延伸* | 是 |
1)PCR反應(yīng)的預(yù)變性條件必須設(shè)定為95℃,15min。
2)選擇報(bào)告熒光基團(tuán)為“FAM”,猝滅熒光基團(tuán)為“TAMRA”。
3)變性*:請(qǐng)按照儀器使用說明書對(duì)不同型號(hào)的儀器進(jìn)行時(shí)間。使用ABI 7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOnePlus時(shí)可設(shè)定為1sec。
4)退火/延伸*:請(qǐng)按照儀器使用說明書對(duì)不同型號(hào)的儀器進(jìn)行時(shí)間。幾種常見儀器的時(shí)間設(shè)定見下表:
使用ABI 7500 Fast/7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOne/StepOnePlus時(shí)請(qǐng)?jiān)O(shè)定在30sec |
使用Roche LightCycler/LightCycler 480時(shí)請(qǐng)?jiān)O(shè)定在20sec |
使用ABI 7000/7300時(shí)請(qǐng)?jiān)O(shè)定在31sec |
使用ABI 7500時(shí)請(qǐng)?jiān)O(shè)定在32sec |
七、判定標(biāo)準(zhǔn)
1) 標(biāo)準(zhǔn)曲線:R2>0.99;擴(kuò)增效率(Eff%):90%≤Eff%≤110%;斜率(Slope):-3.8~-3.1。
2) 加標(biāo)回收率% = (加標(biāo)樣品測(cè)定值-樣品測(cè)定值) /加標(biāo)理論值*100%,范圍50%-150%。
3) 無模板對(duì)照(NTC):即反應(yīng)體系中用DNA稀釋液代替待檢測(cè)模板,其余成分不變,其檢測(cè)結(jié)果Ct值應(yīng)為Undetermined或Ct值≥35。
應(yīng)用: 定量檢測(cè)重組蛋白表達(dá)、中間產(chǎn)物純化及最終成品中殘留DNA的含量
用途: 本試劑盒僅供科研使用,不得用于臨床及診斷使用!
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