一、產(chǎn)品介紹
本試劑盒采用Taqman探針熒光定量PCR法,設(shè)計專屬探針和關(guān)鍵引物,特異性好,靈敏度高,其最低定量限可以達到1fg/μL水平。本試劑盒可與本公司的磁珠法殘留DNA樣本前處理試劑盒(CG-DP050/CG-DP100)配套使用。
DNA參考品制備過程與其它宿主細胞DNA國家標準品制備一致,因此純度高,無蛋白及離子干擾,保證了待測樣品含量檢測的準確度。
試劑盒提供DNA稀釋專用稀釋液,單次實驗復(fù)孔平行性及多次實驗間數(shù)據(jù)重現(xiàn)性好。
二、試劑盒組成
DNA擴增 | |||
組分編號 | 組分名稱 | 產(chǎn)品編號/規(guī)格 | |
50T | 100T | ||
B1 | 2X qPCR Mix | 0.625mL | 1.25mL |
B2 | Primer & Probe Mix | 100μL | 200μL |
B3 | DNA Dilution Buffer | 2×1.5mL | 4×1.5mL |
B4 | DNA Control (10ng/μL) | 25μL | 50μL |
B5 | RNase-Free H2O | 0.5mL | 1mL |
B6 | 50X ROX Reference Dye(可選) | 0.15mL | 0.3mL |
* ROX參比染料為可選,是否使用取決于使用的儀器。具體可參照PART 6中的說明。
三、實驗需要但未提供的耗材及設(shè)備
1. | 移液器:5μL-1000μL | 5. | 迷你離心機 |
2. | 1.5/2mL無DNA酶/RNA酶離心管 | 6. | 無DNA酶/RNA酶8聯(lián)管 |
3. | 200μL無DNA酶/RNA酶PCR管 | 7. | 生物安全柜 |
4. | 渦旋儀 | 8. | 熒光定量qPCR儀 |
四、運輸和保存方法
1) 所有組分均干冰運輸.
2) 試劑盒需-20℃保存,建議一年內(nèi)使用完。其中組分B2需避光保存。
3) B2/B3/B4組分在-20℃可以保存兩年,B1/B5/B6 組分在-20℃可以保存一年。此外B1/B5/B6 三個組分也可以一起另外購買。
五、實驗前準備
1) 使用本試劑前請仔細閱讀說明書,所有成分使用前應(yīng)完全化凍,低速離心,震蕩混勻。
2) 從-20℃冰箱取出,將組分B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)分別融解,輕輕顛倒(盡量避免產(chǎn)生泡沫),待溶液完全均一后再行使用。注:如B1(2X qPCR Mix)和B6(50X ROX Reference Dye)需一段時間內(nèi)經(jīng)常取用,可在2-8℃條件下儲存3個月。盡量避免反復(fù)多次凍融;如解凍后沒有使用,須徹底混勻后重新冷凍。
3) B2 (Primer & Probe Mix) and B4 (DNA Control)在使用前混勻時切勿反復(fù)吹打,可采用類似清洗管壁方式。注:為減少反復(fù)凍融次數(shù)和避免污染,建議初次使用時將B4 (DNA Control)分裝儲存于-20℃(具體操作見標準品稀釋過程)。
4) 已融化未使用的B3 (DNA Dilution Buffer)可保存于2-8℃ 7天,若長時間不用,請放置于-20℃。
5) 為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作,實驗開始前后紫外照射30min以消除環(huán)境中潛在的DNA污染源。
6) 由于熒光定量PCR實驗有極強的靈敏度,保持工作環(huán)境的潔凈非常重要,實驗開始前建議完全清潔移液器及周邊工作環(huán)境,移除清理實驗過程中用不到的任何物品。
六、操作過程
(一)DNA定量參考品的稀釋和標準曲線的制備
1) 將試劑盒中的DNA Control和DNA Dilution Buffer置于冰上完全融化,輕微振蕩混勻,低速離心10 sec。
2) 取7支潔凈的200μL PCR管,分別標記為S0,S1,S2,S3,S4,S5,S6每管各加入45μL DNA稀釋液。
3) 取解凍后的DNA Control(10 ng/μL),快速離心10 sec,振蕩5sec,再快速離心10 sec,該濃度可分裝置于-20℃短期保存(不超過3個月),使用時避免反復(fù)凍融。
4) 在標記為S0(非標準曲線濃度點)的PCR管中加入5μL上述混勻的DNA Control(10 ng/μL),快速離心10 sec,振蕩5sec,再快速離心10 sec,即得到中間濃度為1000pg/μL的S0。
5) S1,S2,S3,S4,S5,S6管稀釋操作同S0,稀釋方法如下:
標準曲線稀釋過程 | 終濃度 | |
S1 | 5μL S0 + 45μL DNA Dilution Buffer | 100pg/μL |
S2 | 5μL S1 + 45μL DNA Dilution Buffer | 10pg/μL |
S3 | 5μL S2 + 45μL DNA Dilution Buffer | 1pg/μL |
S4 | 5μL S3 + 45μL DNA Dilution Buffer | 100fg/μL |
S5 | 5μL S4 + 45μL DNA Dilution Buffer | 10fg/μL |
S6 | 5μL S5 + 45μL DNA Dilution Buffer | 1fg/μL |
(二)反應(yīng)體系
組分 | 體積(μL) |
2X qPCR Mix | 12.5 |
Primer&Probe Mix | 2 |
DNA template(control or sample) | 5 |
補加水 | 5.5 |
總體積 | 25 |
【注】:
l 根據(jù)反應(yīng)孔數(shù)計算本次所需Mix混合液總量:Mix混合液=(反應(yīng)孔數(shù)+4)*(12.5+2+5.5)μL(含有4孔的損失量),建議冰上操作。
l 標準品及待測樣本每個濃度做 3 個復(fù)孔。上述標準曲線的線性范圍適用大多數(shù)實驗,可根據(jù)實際需要適當(dāng)調(diào)整,如30fg/μL-300pg/μL等。
l 實驗操作應(yīng)保持一致。加樣完成密封好管子后,請低速離心10 sec將管壁的液體離心收集至管底,再震蕩混勻5 sec以上,完全混勻反應(yīng)液,再低速離心10 sec,如有氣泡,需將氣泡排盡。
l 為確保實驗結(jié)果準確性,建議用1X PBS將溶液中蛋白濃度稀釋至1-10mg/mL進行加標回收率實驗,確?;厥章试?0%~150%之間。
l 幾種常見儀器的匹配ROX Reference Dye濃度見下表:
儀器 | 終濃度 |
ABI PRISM 7000/7300/7700/7900HT/Step One等 | 2.5X(例如:1.25μL ROX/25μL體系) |
ABI 7500/7500Fast Stratagene Mx3000P/Mx3005P/Mx4000等 | 0.5X(例如:0.25μL ROX/25μL體系) |
Roche/Bio-Rad/Eppendorf儀器等 | 不用添加 |
(三)擴增程序設(shè)置(2步法)
階段 | 溫度(℃) | 時間 | 內(nèi)容 | 熒光信號采集 | 循環(huán)數(shù) |
預(yù)變性 | 95℃ | 15 min | 預(yù)變性 | 否 | 1 |
PCR反應(yīng) | 95℃ | 3 sec | 變性* | 否 |
40
|
60℃ | 30 sec | 退火/延伸* | 是 |
【注】:
l PCR反應(yīng)的預(yù)變性條件必須設(shè)定為95℃,15min。
l 選擇報告熒光基團為“FAM”,猝滅熒光基團為“TAMRA”。
l 變性*:請按照儀器使用說明書對不同型號的儀器進行時間。使用ABI 7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOnePlus時可設(shè)定為1sec。
l 退火/延伸*:請按照儀器使用說明書對不同型號的儀器進行時間。幾種常見儀器的時間設(shè)定見下表:
使用ABI 7500 Fast/7900HT/7900HT Fast/ViiA 7/StepOne/StepOnePlus時請設(shè)定在30sec |
使用Roche LightCycler/LightCycler 480時請設(shè)定在20sec |
使用ABI 7000/7300時請設(shè)定在31sec |
使用ABI 7500時請設(shè)定在32sec |
七、判定標準
1) 標準曲線:R2>0.99;擴增效率(Eff%):90%≤Eff%≤110%;斜率(Slope):-3.8~-3.1。
2) 加標回收率% = (加標樣品測定值-樣品測定值) /加標理論值*100%,范圍50%-150%。
3) 無模板對照(NTC):即反應(yīng)體系中用DNA稀釋液代替待檢測模板,其余成分不變,其檢測結(jié)果Ct值應(yīng)為Undetermined或Ct值≥35。
應(yīng)用: 定量檢測重組蛋白表達、中間產(chǎn)物純化及最終成品中殘留DNA的含量
用途: 本試劑盒僅供科研使用,不得用于臨床及診斷使用!
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